GenSeq : Génotypage - Séquençage Génomique environnementale
Ce plateau technique est situé au 1er étage du Bâtiment 24 du campus Triolet de l’Université de Montpellier. Il est spécialisé dans les technologies d’analyse génétique moléculaire dans le cadre de programmes d’études portant principalement sur la Biologie Evolutive et l’Ecologie des espèces sauvages et/ou patrimoniales. Il est cependant ouvert à tout projet portant sur d’autres champs disciplinaires.
Localisation :
ISEM
Description
Il propose les moyens nécessaires à l’obtention d’analyses de qualité : expertise, équipement, infrastructure et maintenance.
Plusieurs technologies y sont proposées :
- Extractions haut-débit d’acides nucléiques.
- Analyse quantitative et qualitative des ADN ou ARN.
- Manipulation automatisée d’échantillons pour leur préparation et analyse.
- Electrophorèse capillaire pour génotypage et séquençage Sanger.
- Fragmentation de molécules par ultra-son
- Préparation de banques d’ADN génomique ou d’amplicons.
- Séquençage nouvelle génération sur séquenceur MiSeq d’Illumina
Le personnel de la plateforme assure le fonctionnement, la mise à niveau et l’entretien périodique des appareils.
Equipements
- > KingFisher Flex DNA or RNA automatic extraction robot
- > MiSeq Illumina sequencer
- > ABI 3130XL 16 capillary and ABI 3500XL 24 capillary sequencers
- > Biomek 4000 pipetting robot
- > Covaris S220 sonicator
- > Pippin Prep automatic DNA collector
- > 2 Eppendorf thermocyclers, one with a temperature gradient
- > Nanodrop 8000 Spectrophotometer
- > Qubit Fluorimeter
Fonctionnement
Contact :
Responsables: Erick Desmarais et Frédérique Cerqueira
Contact:
ISEM, CC063, Bât. 24, 1er étage
Université Montpellier 2, Place E. Bataillon
Montpellier
genseq-contact@umontpellier.fr
04 67 14 46 89
Galerie photo
