FINN kjellberg
CEFE, CNRS, Univ Montpellier, EPHE, IRD, Montpellier, France
La plateforme MBB organise une formation destinée aux unités membres du LabEx CeMEB. Cette formation se déroulera en deux demi journées, le 07/12 et le 08/12 de 13h à 18h au sein du campus Triolet de l'UM. Cette formation s'adresse aux personnes souhaitant s'initier à l'utilisation d'un cluster de calcul et apprendre à traiter de gros volumes de données (type NGS). Les points suivants seront abordés : Première demi-journée : - Rappel sur les bases de la ligne de commande sous Linux - Manipulation de fichiers, droits, archivage, compression, transferts - Le chaînage des opérations pour la construction de pipelines - Utilisation du cluster (soumission de tâches, monitoring...) Deuxième demi-journée : - Les expressions régulières pour la recherche de motifs de texte - Outils simples de manipulation massive de texte (tail, grep, cut...) - Manipulation de texte avancée avec les outils sed et awk Cette formation gratuite se divisera en courts exposés introductifs et en sessions de travaux pratiques encadrés et interactifs.
Pour info, cette formation sera suivie d'une autre qui aura pour thème l'amélioration des performances des traitements sur un cluster de calcul (méthodes de parallélisation, optimisation).
SUR INSCRIPTION, Le nombre de places est limité à 15.
Julien Veyssier, plateforme MBB (ISEM)