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Workshop « Modélisation et simulation numérique des plantes »

Le 23 Mai 2017
Amphithéâtre de la délégation LR du CNRS



Workshop

« Modélisation et simulation numérique des plantes »
 

Mardi 23 Mai 2017

Amphithéâtre de la délégation LR du CNRS, Route de Mende.

Inscription gratuite mais obligatoire : s'inscrire ici

 

Les Labex NUMEV, AGRO et CEMEB mettent en place une animation scientifique autour de la modélisation numérique des plantes. De nombreuses équipes du site Montpelliérain sont engagées dans des recherches liées à ce thème, et des interactions existent déjà entre les acteurs des trois Labex. L’objectif de ces journées est d’amplifier et diversifier ces échanges, dans le cadre d’une politique de site visant à (i) améliorer la visibilité des activités de recherche et formation, et (ii) promouvoir les collaborations entre communautés porteuses de visions disciplinaires complémentaires pour faciliter l'émergence de questions scientifiques et défis technologiques innovants.

Le champ thématique couvert concerne toutes les approches visant à décrire et expliquer le fonctionnement des plantes d’une manière numérique ou en utilisant les outils numériques, d’où l’intitulé « Modélisation et Simulation Numérique des Plantes ». Les démarches expérimentales associées à un objectif de modélisation sont bienvenues, de même que des approches connexes (variabilité, environnement…) pourvu qu’elles concernent la représentation de la plante. Un intérêt particulier sera porté à des questions de recherche suscitant des interactions pluridisciplinaires entre plusieurs acteurs du site.

Après un bref compte-rendu de l’activité passée des Labex dans ce domaine, la parole sera donnée à des chercheurs représentatifs des recherches menées sur le site. Ils présenteront les questions qu’ils se posent et les approches et méthodes qu’ils mettent en œuvre, dans l’esprit de susciter de nouvelles collaborations. La journée sera ponctuée par deux tables rondes.

Des informations liées au thème seront données à l'occasion de cette journée: appels à projet à venir, lancement du GDR PhyP, etc…

PROGRAMME

 

 MATIN : Session « Biomecanique et flux »

9h00

Introduction par les directeurs de LabEx

9h30

D. FELBACQ (L2C), Y. BOURSIAC (BPMP)

Modélisation multi-échelle du transport de l'eau dans une racine

10h00

T. FOURCAUD (AMAP), F. GERARD (ECO&SOLS), J. BARES (LMGC)

Rôle et fonctionnement de l'interface racines-sols

10h30

Pause café

10h50

T. ALMERAS et O. ARNOULD (LMGC)

Modélisation du fonctionnement biomécanique des tiges ligneuses

11h20

B. PALLAS (AGAP), T. SIMONNEAU (LEPSE)

Variabilité génétique et environnementale des flux d'eau, de carbone et d'hormones chez les ligneux pérennes : quelques illustrations des apports de la modélisation structure fonction

11h40

C. PRADAL (AGAP), C. FOURNIER (LEPSE)

OpenALea : une plateforme logicielle libre pour la modélisation des plantes à différentes échelles

12h00

Yoël FORTERRE (IUSTI Marseille)
Présentation du GDR PhyP

12h05

Table ronde  « Liens/continuum Données-Modèles-Outils », animée par Andrea Parmeggiani (L2C) et Christophe Maurel (BPMP)

12h30

Déjeuner (buffet)

 

 

APRES-MIDI : Session « Développement des plantes et réponses à l’environnement »

14h00

G. KROUK (BPMP), A. MAS (IMAG)

Gene Regulatory Networks: lessons from plants

14h20

JF. BARCZY (AMAP), S. CHAMAILLE (CEFE)

Comment les plantes se protègent structurellement des brouteurs ? Observation-expérimentation-modélisation-simulation

14h40

D. COQUILLAT (L2C), B. ORSAL (IES)

Spectroscopie et Imagerie Terahertz appliquée aux plantes. Potentiel des signaux de fluorescence de la chlorophylle a et des signaux IR et TeraHertz pour évaluer le niveau de résistance des cultures de vigne vis-à-vis de Plasmopara viticola

15h00

Y. DUMONT (AMAP)

Sur la modélisation mathématique des interactions Plante-Insecte

15h20

Pause café

15h40

J. DAUZAT, Y. CARAGLIO (AMAP)

L’arbre caché par la forêt… ou vision croisée botanique et fonctionnelle sur l’édification architecturale d’un arbre

16h00

D. LUQUET (AGAP), Raphaël Perez (LEPSE), Michaël Dingkhun (AGAP)

Apport de la modélisation à l'amélioration des plantes et à la définition d'idéotypes variétaux

16h20

Table ronde  « Apports de la modélisation pour l’agronomie, l’écologie et la diversité », animée par Evelyne Costes (AGAP) et Richard Joffre (CEFE)

16h50

Conclusions et perspectives par les directeurs de LabEx

17h30

Fin de la journée

Workshop  « Modélisation et simulation numérique des plantes »