Montpellier Bio-informatique et biodiversité - MBB | Labex Cemeb

Montpellier Bio-informatique et biodiversité - MBB

Le service commun “Calcul scientifique” est une initiative de mutualisation des ressources informatiques dédiées au calcul et à la bioinformatique.
Il propose non seulement un accès à des machines de calculs intensif  mais également une aide aux utilisateurs désireux de développer leurs propres codes informatiques sur ces machines

Localisation : 
ISEM
Description

La plateforme MBB a pour but de stimuler les recherches des unités faisant appel aux aspects computationnels dans les domaines de l'évolution et de l'écologie. MBB propose l’hébergement de logiciels, l’assistance au développement de code, l’accès au cluster de calcul, aux machines « Big data », et au serveur RStudio.

Equipements

Hébergement de logiciels : Pour les utilisateurs désirant intégrer leurs programmes comme outil "online" ou comme binaire/source téléchargeable sur le site web de la plateforme.

- Assistance au développement de code : ce service permet d'apporter de l'aide aux chercheurs pour la parallélisation / optimisation de programmes, le portage de code sur différents OS, l'utilisation de librairies graphiques, le packaging, la compilation et la mise en place de forges logicielles.

- Accès au cluster de calcul : Les membres du LabEx ont la possibilité de demander un compte SSH pour l'accès au cluster MBB. Ce compte permet l'accès à un cluster sous Linux composé de 200 cœurs gérés par Open Grid Scheduler Queue Manager.

- Accès aux machines "BigData" : 5 serveurs à grandes capacités (512 Go RAM, 64 coeurs et 6 To de disque) sont disponibles pour des réservations de 2 à 4 semaines. Ces serveurs sont dotés de machines virtuelles avec la distribution CloudBioLinux permettant aux utilisateurs un accès exclusif pendant la durée de la réservation.

- Serveur RStudio : Un serveur sous Linux est doté de l'interface RStudio permettant la mise au point de scripts R et leur exécution sur les ressources dédiées de cette machine.

- Cluster de calcul 8 coeurs, 328 Go de Ram
- Calcul sur GPU
- Une machine équipée d'une carte NVidia Tesla K20 (2496 cores GPU et 5GB de mémoire GDDR5) pour compiler ou lancer des codes compatibles CUDA.

Contact : 
Responsable: Khalid Belkhir
 
Remy Dernat
 
 
CC063, Bât. 24, 1er étage
Université Montpellier, Place E. Bataillon
34095 Montpellier CEDEX 05